防火墙与安全隔离网闸的最大区别可以从两个方面来谈：
1. 设计理念的不同
2. 系统的整体设计完全不同
在设计理念方面，防火墙是以应用为主的安全为辅的，也就是说在支持尽可能多的应用的前提下，来保证使用的安全。防火墙的这一设计理念使得它可以广泛地用于尽可能多的领域，拥有更加广泛的市场。而网闸则是以安全为主，在保证安全的前提下，支持尽可能多地应用。网闸主要用于安全性要求极高的领域，例如对政府网络，工业控制系统的保护等等。显然，由于把安全性放在首位，这样就会有更加严格的安全规则和更多地限制，因此可以应用的范围也较防火墙少一些，主要用那些对安全性要求较高的环境下。相反防火墙可以应用于非常广泛的应用领域，甚至包括个人电脑都可以使用，但是它的安全性往往就差强人意。人们常常发现被防火墙防护的网络依然常常被黑客和病毒攻击。现在有很多网络攻击都是发生在有防火墙的情况下，根据美国财经杂志统计资料表明，30%的入侵发生在有防火墙的情况下。由于这种设计理念的区别，因此可以有软件防火墙，但是却不会有软件网闸。
由于设计理念的不同也导致系统的整体设计也完全不同。硬件防火墙虽然可以有多种设计方式，但是一般来说，它都是单一的计算机系统由一个操作系统来控制构的，用户的内网和外网都连接在这同一个系统上。然而安全隔离网闸却完全不同，它自少由三部分组成，内网处理单元，外网处理单元和一个隔离岛。一般来说，内外网处理单元是两个完全独立计算机的系统构，拥有各自独立的操作系统。内网处理单元与用户的内网相连，外网处理单元与外部网络相连，内外网处理系统之间通过隔离岛进行非协议的信息交换。可以看得出来，网闸的结构较防火墙要复杂的多，显然有两个独立的系统分别连接内外网，中间再由隔离岛隔离，要比防火墙的设计要安全得多，当然设计的难度也要高得多。当然区别不仅仅如此，由于设计理念以及硬件结构的完全不同，在软件设计上也有很大的区别，很很高的难度，这里就不再细说。